L'eremo delle carceri si trova a 4 Km dalla Porta Cappuccini di Assisi salendo verso il Monte Subasio in una fitta selva di lecci e di querce, in posizione panoramica a 790 metri slm, è un classico luogo solitario Francescano dove nel suo ancestrale silenzio ancora oggi si può cogliere il "senso" della predicazione del Santo.

L’Eremo è un’oasi di pace e di silenzio, nella selva del Subasio - tra i boschi di lecci e di querce - dove Francesco si ritirava in preghiera e i frati eressero poi il caratteristico convento. Si trova a quattro chilometri dalla Porta Cappuccini, e a 790 metri sul livello del mare. Gli edifici del convento sono arroccati sopra il Fosso delle Carceri. Da un piccolo chiostro con due pozzi si accede al refettorio, alle celle dei frati, alla Chiesetta di San Bernardino.
Dal Convento, scendendo una ripida scalinata, si arriva alla grotta di San Francesco: un umile giaciglio ricavato nella roccia in cui il Santo si riposava utilizzando un tronco come cuscino. All'esterno della grotta, si trova un enorme leccio secolare dove si dice che gli uccelli sostassero per ascoltare le parole del Santo e si può inoltre notare un buco nel terreno, dal quale si vede il fondo del burrone, che è stato aperto dal demonio quando è stato cacciato da frate Rufino.